Las infecciones sin tratar pueden causar daño estructural o tener un efecto negativo en la producción de esperma sano. Por lo tanto, hay una serie de enfermedades y dolencias generales que producen fertilidad reducida como posible efecto secundario. Debido a que el proceso de producir nuevos espermatozoides dura aproximadamente 3 meses, el efecto de las dolencias o enfermedades es temporal en algunos casos, y la función espermática normal se reanuda con el paso del tiempo. Además de las consecuencias de una infección, la fiebre sola puede tener un efecto negativo en la calidad de los espermatozoides. El uso de algunos medicamentos también puede afectar negativamente la fertilidad masculina.

La fertilidad reducida también puede ser un efecto secundario desafortunado de muchos estados de salud o enfermedades, incluyendo diabetes, fibrosis quística (enfermedad de las membranas mucosas) y paperas. Todas las enfermedades que se asocian a un período extenso de fiebre alta también pueden causar menor producción espermática. No obstante, por lo general, los efectos de la fiebre son de naturaleza temporal.

Las infecciones del tracto urinario se caracterizan generalmente por un dolor punzante al orinar, y su causa y tratamiento son los mismos que para los casos de epididimitis. Estas enfermedades pueden tratarse con antibióticos, pero en conjunto con una posible fiebre, también pueden tener un efecto negativo en el esperma. Este efecto es a menudo temporal.

El riesgo de una fertilidad reducida como resultado de una ETS es alto, como se observó en el caso de la epididimitis. Pero al menos los hombres tienen la “ventaja” de notar de vez en cuando los síntomas, y pueden así recibir tratamiento (muchas de las ETS, como la gonorrea, con frecuencia no manifiestan signos ni síntomas en las mujeres). Como algunas cepas parecen ser resistentes a los medicamentos, el tratamiento puede llevar más tiempo de lo esperado. Muchos hombres pueden también padecer ETS sin síntomas aparentes (asintomáticas), enfermedades producidas por organismos tales como la clamidia, la ureoplasma o la micoplasma, las que pueden o no afectar la fertilidad del hombre. Pero dado que estas enfermedades son transmitidas sexualmente, pueden tener un efecto profundo en la fertilidad de su compañera.

Una infección puede interferir con el funcionamiento del epidídimo (donde se almacena la esperma) y, por lo tanto, con la producción de esperma sano. En un caso de epididimitis, los testículos se inflaman debido a la infección, lo que a menudo causa dolor. Las enfermedades de transmisión sexual (ETS) son las causantes más frecuentes de infecciones del epidídimo. Habitualmente, una infección bacteriana puede curarse con antibióticos; sin embargo, la producción espermática puede dañarse permanentemente. La orquitis por parotiditis (paperas) ocasionalmente se produce en los varones jóvenes. Esta inflamación del epidídimo está causada por el virus de las paperas. Esto puede provocar alteraciones de la fertilidad debido a la producción de esperma anómalo en el hombre en el transcurso de su vida.

Las enfermedades graves como el cáncer, pueden tener un enorme efecto en muchos aspectos de la vida. Desafortunadamente, el cáncer también puede afectar la infertilidad masculina de varias maneras:

• Los tratamientos de quimioterapia y de radiación pueden dañar o destruir las células del sistema reproductor.
• La esterilidad es un efecto secundario de muchos medicamentos utilizados para tratar el cáncer.
• Para el cáncer, puede ser necesario extraer los órganos reproductores, lo que dará lugar a un sistema reproductor dañado.

Como observación más positiva, los médicos y la comunidad médica en su conjunto tienen cada vez más en cuenta las preocupaciones que a menudo tienen los pacientes con cáncer acerca de la conservación de su fertilidad. Muchos pacientes con cáncer ahora pueden planificar con antelación recolectando el esperma antes del tratamiento y almacenándolo congelado (crioconservación).