Defectos en el sistema reproductor en sí también pueden causar problemas de fertilidad. Algunos de estos defectos pueden ser congénitos, mientras que otros pueden surgir en una etapa posterior de la vida.

En este capítulo se tratarán los diferentes defectos, especialmente de ovarios, trompas de Falopio y de útero, todos los cuales pueden ejercer influencia en la infertilidad.