La infertilidad inmunológica no ocurre muy a menudo, pero es un poco más común en los hombres que en las mujeres. El sistema inmunológico masculino puede reaccionar contra sus propios espermatozoides como si fueran células invasoras (como en una infección o el cáncer). El sistema inmunológico atacará a los espermatozoides y de ese modo los tornará infértiles.

Aunque parezca que una infección no está presente, todavía podría estar latente en el organismo una infección anterior que no fue completamente destruida.

En la actualidad, la causa de la infertilidad inmunológica aún se desconoce en gran medida. Se sabe que los hombres que fueron esterilizados y luego se sometieron a una reversión de vasectomía a menudo producen anticuerpos.

El tratamiento para este estado varía desde la terapia farmacológica a las técnicas de reproducción asistida.